Создатель Metal Gear Хидео Кодзима чуть было не отменил Metal Gear Solid 2 и не уволился из Konami после террористической атаки на башни-близнецы 11 сентября 2001 года. Он утверждает, что после этих событий игре потребовались сотни правок, а разработчики были в кризисной ситуации.
В конце игры гигантская военная крепость Arsenal Gear обрушивается на Манхэттен, но в финальной версии показаны только события до и после, а остальное предоставлено воображению игрока.
«Тематика игры и ее многочисленные сходства с реальными событиями 11 сентября сделали Metal Gear Solid 2 непригодной для выпуска в то время. После консультаций с юристами игра потребовала доработок в 300 местах. Разумеется, мы были в кризисном режиме. Это угрожало выпуску и продажам игры» — делится Гений
Совет директоров Konami вызвал Хидео на встречу насчет сюжета игры. По их лицам было видно, что ситуация нехорошая. Кодзима посчитал, что он не может выпустить игру в такой период, а поэтому решил взять ответственность на себя и уволиться из компании. Его убедили остаться Кен Кутараги, тогдашний президент Sony, и Кагемаса Кодзуки, основатель Konami.
Релиз был отложен до ноября 2001 года и игра успешно вышла. За ней последовала хитовая Metal Gear Solid 3, которая получит ремейк.