Перед началом игры нас ждет небольшое обучение в Амнимусе. После этого выполняем несложную миссию по убийству человека в театре и отправляемся на корабле в Новый Свет. Во время плавания можно попробовать себя в минииграх «Фанорон» и «Мельница».Выполняем несколько вводных миссий на корабле и, наконец, оказываемся в Бостоне 18 века. Здесь нас встречает Чарльз Ли, который и вводит в курс дела. Первое задание – вернуть Бенджамину Франклину его утерянные альманах. За ними придется побегать по всему городу. Почти тут же берем второе поручение от Джонсона. Для завершения квеста необходимо напасть на заставу наемников. Затем берем еще одно задание, которое заключается в том, что нанять еще одного человека в свою команду. Для этого сначала необходимо найти и освободить доктора Черча.
Далее перемещаемся в Ли в полк военных. Здесь нам необходимо найти некоего Питкэрна. Он отказывается с нами сотрудничать. Мы возвращаемся в город, где начинается новая миссия «Проникновение в Саутгейт». Забираемся на крышу и пикируем оттуда на повозку. Переодеваемся в военные мундиры и так въезжаем в закрытый форт. Здесь нам необходимо убить Сайруса.
После этого сюжет игры переносит нас на три месяца вперед. Нам необходимо добраться до Фронтира и найти здесь Чарльза, чтобы затем отправиться на поиски индейской девушки. Она приводит нас к лагерю. После этого мы отправляемся с ней к аванпосту. Необходимо незаметно проникнуть в это поселение и выполнить сопутствующие миссии.
Снова перемещаемся во времени на пять месяцев вперед и проходим миссию «Экспедиция Брэддока». Основная задача на миссию – напасть на экспедицию и убить ее предводителя. Далее проходим миссию «Прятки», в которой нам предстоит играть не за своего привычного персонажа, а за сына индейской девушки. Миссия проста, нужно лишь найти четверых детей, с которыми ребенок играет в прятки. После нее по сюжету мы окажемся еще дальше в будущем. Теперь нам предстоит играть за четырнадцатилетнего индейского мальчика. Основная задача на миссию – найти определенное количество птиц. Суть миссии «Уроки охоты» понятна из названия. В ней необходимо убить издалека зайца из лука. Миссия «Будет что вспомнить» позволяет перевоплотиться в птицу и сделать головокружительный перелет.
Далее мы попадаем в 1769 год. Во Фронтире нам предстоит найти старика Ахиллеса и попытаться уговорить его обучить нас навыкам искусства ассасинов. Получаем отказ и идем выполнять дополнительные миссии. В миссии «Поручение Ахиллеса» выполняем небольшое задание старика и получаем его согласие. Почти сразу после этого вы оказываетесь в списке особо опасных преступников и учимся жить с дурной репутацией. Название миссии «Спасение на реке» говорит само за себя. Используйте бревно для того чтобы вытащить утопающего из воды. Переносимся еще на несколько месяцев вперед и обкатываем корабль «Аквилла». Наконец, возвращаемся в наше время и отключаемся от Амнимуса. Выполняем здесь несколько несложных заданий.
Снова возвращаемся в прошлое. На сей раз – в город Девенпорт в 1773 год. Идем «По следу Джонсона» , помогаем «Повару в гневе», продолжаем уничтожать наших врагов в «Чаепитии», проводим «Агрессивные переговоры». Время снова переносит нас вперед в 1775 год. Обстановка здесь царит намного более напряженная, борцы за свободу сорганизовались в вооруженную армию и теперь активно преследуют сторонников монархии. Ваше первое задание – объехать все окрестные селения и предупредить о появлении британских войск. После этого, конечно, придется и самому поучаствовать в вооруженных столкновениях двух сторон.
В предчувствии того, что «Война надвигается», получаем новое задание – найти и убить тамплиера Пиркерна, того самого, с которым мы разговаривали в самом начале игры. После возвращаемся в лагерь повстанцев и принимаем участие в одной из самых полномасштабных битв своей эпохи - «Битве при Банкер-Хилле». Здесь же нам представится возможность убить тамплиера с воздуха. После того как задание будет выполнено, попадаем в Нью-Йорк 1776 года. Здесь встречаемся с нашим осведомителем и выслеживаем фальшивомонетчика. Далее в новой локации отправляемся в «Тюрьму Брайдуэлл» в качестве пленника. Пытаемся провернуть здесь убийство нашего врага. Терпим неудачу и отправляемся на смертную казнь. От печального исхода нас спасают вовремя прибывшие союзники. На этом наше пребывание в Нью-Йорке заканчивается и мы отправляемся в Филадельфию. Здесь нас встречает Ахиллес, и вместе со стариком мы становимся свидетелями подписания Декларации независимости. Снова перемещаемся в наше время. Едем в Бразилию, чтобы найти новый источник энергии. Возвращаемся в Амнимус и попадаем в Девенпорт в 1777 год. Проходим миссию «Пропавший груз», в которой нам предстоит встретится с Джорджем Вашингтоном и найти пропавшие повозки. В миссии «Отец и сын» встречаемся с Хейтемом в Нью-Йорке. Перебираемся по крышам к зданию, в котором находится Бенджамин Черч.
Далее отправляемся с проводником к пивоварне, отбиваемся от засады, пытаемся найти Черча, но его здесь уже нет. Проходим миссию «Горький опыт», в которой нам предстоит отправиться на поиски уплывшего в Карибское море Черча и убить его. Перемещаемся во времени в 1778 год и оказываемся в Девенпорте. Проходим «Альтернативные методы»
и берм в плен командиров британской армии. Отводим их в комнату для допроса. Отправляемся в полевой лагерь к Джорджу Вашингтон и узнаем, что на нашу деревню вот-вот нападут. Стараемся помешать кровавой резне и убиваем всех гонцов, везущих военные поручения и обезвреживаем самых агрессивно настроенных индейцев. Принимаем решение убить Чальза Ли, поскольку он продолжает подбивать деревню на восстание. Снова скачем в полевой лагерь, чтобы успеть принять участие в «Битве при Монмуте». Перемещаемся в наше время и выходим из Анимуса. Выполняем задание по освобождению отца из логова врагов. Подаваем в 1781 год в Девенпорт. Принимаем участие в «Чесапиксом сражении», и «Последней битве Ли». Оказываемся в Нью-Йорке 1782 года, приходим на похороны Хэйтема, обнаруживаем здесь Чарльза Ли. Пытаемся узнать, куда он скрылся. Устраиваем погоню за Ли, выслеживаем его до Бостона. Используем орлиное зрение, чтобы найти его в городе. В итоге заходим на корабль, где находится Чарльз. Садимся с ним за один столик и быстро убиваем противника.
Перемещаемся в наше время. Находим ключ, идем в пещеру и устанавливаем источники энергии. Вставляем артефакт, найденный у Чарльза в прозрачную стену в центре пещеры.
Игра пройдена.
Несколько примеров прохождения миссий «Бостонское чаепитие:
(смотреть с 1-й минуты).
Пример прохождения миссии «Война надвигается:
(смотреть с самого начала)
«Чесапикское сражение:
(смотреть со 2-й минуты).
Прохождение «Последней битвы Чарльза»:
(смотреть с 1-й минуты).
