Оказавшись в небе, открываем огонь (играть можно как за Супермена, так и за Бэтмана на вертолете) по обшивке криптонитового корабля. Когда кусок обшивки отвалится, отбиваемся от прибывших вертолетов, а затем уничтожаем две стационарные пушки в левой части этого «монстра». Как только мы окажемся в безопасности, открываем массированный огонь по левому двигателю. После того, как двигатель откажет, огибаем корабль и расправляемся с центральными орудиями.
Повторив вышеописанные действия с правым двигателем, дожидаемся открытия трюма и проникаем внутрь. Играя за Супермена, уничтожаем четыре золотых блока лазерным лучом (два снизу и два сверху), после чего деактивируем робота-охранника. Пробравшись внутрь, расправляемся с вертолетом. Для этого необходимо крюком вырвать защитное стекло с кабины, а затем поразить пилота бетарангом. Когда вертолет рухнет, переключаемся обратно на Супермена и взаимодействуем с зеленым экраном.
Для дальнейшего продвижения нам необходимо вырубить подачу тока – для этого нужно прокрутить каждую деталь в механизме (тот самый зеленый экран) ровно один раз. Когда электричество перестанет поступать к «раздевалке» Бэтмана, переодеваем его в электрический костюм и вытягиваем энергию из генератора правее, после чего закачиваем ее в генератор подъемника. Забравшись на верхний этаж, запрыгиваем обоими персонажами на рычаги, после чего вырезаем лазерным лучом на золотой стене силуэт летучей мыши.
Пробравшись внутрь, переключаемся на Темного рыцаря (Кларку Кенту, согласитесь, дела с криптонитом лучше не иметь) и сбиваем замки с четырех шкафчиков, после чего собираем из выпавших деталей заслонку. Выломав двери при помощи супер-силы, напяливаем джетпак и уничтожаем несколько серебряных коробок бомбами. Расправившись с оставшимися бандитами Лекса, собираем из обломков механизм для подъема ракеты и активируем его.
Как только ракета окажется на корабле, переключаемся на Супермена и бьем по детонатору лазерным лучом. Оказавшись в комнате с криптонитовыми воротами, взлетаем вверх и смотрим ролик. Лексу и Джокеру в очередной раз удалось от нас ускользнуть…