Просмотрев вступительный ролик, усаживаемся за стационарный пулемет и открываем огонь по вражеской базе. В конечном итоге противники натравят на вас парочку вертолетов. Уничтожаем их и смотрим ролик. Прослушав забавный инструктаж, перепрыгиваем через пропасть и проскальзываем под упавшим стволом дерева. Заметив первого врага, садимся на корточки и бесшумно его нейтрализуем. Выслушав очередную порцию «обучающей информации», активируем киберзрение и помечаем врагов. Так их легче будет отследить в дальнейшем. Швырнув кубик в кусты, дожидаемся любопытного часового и расправляемся с ним. Вырвав у ублюдка сердце (киберсердца понадобятся нам в дальнейшем – постарайтесь в прологе запастись хотя бы десятком) и отправляемся дальше. Наткнувшись на группу наемников, аккуратно приближаемся к самому крайнему и атакуем его при помощи «быстрого убийства», после чего зажимаем кнопку «W». Если все прошло как надо, то Рекс проведет серию убийств. Закончив, забираемся на крышу ангара и спускаемся вниз через люк.
Про скрытность можете забыть – достаем самую крутую пушку и принимаемся за зачистку базы. Когда все противники будут мертвы, встречаемся с Пауком у входа в лабораторию и смотрим ролик. Спустившись вниз на лифте, движемся прямо по коридору, изредка постреливая по одиноким бойцам «Омеги». Вскоре дорогу нам перекроет тяжелобронированный наемник. Убивать его быстро мы пока не умеем (прокачка в игре автоматическая), так что придется воспользоваться гранатами. Прикончив ублюдка, прикрываем Паука, пока тот открываем дверь, и смотрим очередной ролик. Оказавшись на мостике, достаем снайперскую винтовку и зачищаем верхний уровень, после чего поднимаемся туда по лестнице. Обнаружив панель управления баллистическими ракетами «Red Spear», готовимся к нападению. Наша задача – прикрывать Паука, пока тот будет хитрить с компьютером. Всего будет пять волн врагов – как обычных, так и тяжелобронированных . Будьте внимательны – если Паука убьют, то миссия будет провалена. Когда наш напарник закончит с приборами, быстро бежим к лифту и смотрим ролик.