Игра начинается в конце пятнадцатого века: инквизиция обвиняет главного героя в колдовстве и собирается изощренно его пытать. К счастью для Джона, он получает уникальную способность – бессмертие. Происходит это в результате алхимической мутации. Возникает только одна проблема: воскреснув, герой напрочь лишается всех воспоминаний из прошлой жизни.
Далее игра переносится в наше время, где Джон и подруга Полин хотят повторить древний ритуал. Им нужно отыскать артефакт, на который положили глаз люди с нехорошими намерениями.
Yesterday: Origins сочетает в себе элементы классического квеста, детективной истории и веселой адвенчуры. Игра отличается увлекательным сюжетом, проработанными образами персонажей и оригинальными головоломками.