Mushroom Wars 2 — это вторая часть стратегии в реальном времени, где игрокам предстоит отправиться в путешествие по четырем кампаниям разных племен Грибного народа, по полному приключений мультиплееру, сыграть вместе в режиме кооператив.
В игре сюжетная кампания состоит из четырех эпизодов, в каждом по 50 миссий. Режим мультиплеера не имеет сюжетной линии, дает 4 игрокам возможность сражаться одновременно, в том числе с друзьями в режиме «Своя игра», «Каждый сам за себя» и командных матчах. Режим «схватка» позволяет игрокам сражаться против ИИ соперников (управляемых компьютером).
В игре три типа зданий: деревни, которые производят воинов, башни, защищающие территорию определенного радиуса, и кузницы, создающие оружие для повышения защиты и атаки армии. Деревни можно улучшать трижды, чем выше уровень деревни, тем больше воинов в нее помещается, а также увеличивается скорость производства юнитов.